Усаґі Цукіно все ще намагається збалансувати своє домашнє життя з обов'язками Сейлор Мун, охоронниці любові та справедливості. Разом з іншими Сейлор-воїнами та її хлопцем Мамору Чіба вони починають розслідувати справи учнів Академії Муґен, навчального закладу для найелітніших учнів, які перетворюються на монстрів. Під час розслідування вони знайомляться з трьома дивними особистостями: Харука Тено, вродлива автогонщиця, Мічіру Кайо, талановита скрипалька, і Хотару Томое, загадкова дівчина зі слабкою статурою.

У міру того, як відбувається все більше інцидентів, на Сейлор-воїнів чекає ще одна несподіванка – поява двох нових планетарних захисників зі своїми власними мотивами. Незважаючи на сумнівну відданість новачків Усаґі та її товаришам, усі вони стикаються із загрозою від спільного ворога: злої сутності, яка називає себе Фараоном 90.