Колись магія онмьодо була потужною технікою, яку японці використовували під час Другої світової війни, щоб здобути перемогу та утвердити свою націю як грізну силу. Але Японія швидко зазнала поразки після того, як шанований онмьоджі Яко Цучімікадо спричинив «Велику духовну катастрофу», подію, яка дошкуляє Токіо і донині. В результаті цього нещастя було створено агентство «Онмьо» з метою вигнання подальших духовних катастроф і боротьби з демонами, які прокладають собі шлях у світ.

Зараз онмьодо стала набагато сучаснішою, спрощеною і вдосконаленою для використання в найрізноманітніших сферах, таких як медицина і технології. Однак не всі здатні використовувати магію, як у випадку з Харуторо, членом родини відгалуження Цучімікадо. Незважаючи на давню обіцянку захищати Нацуме, спадкоємицю головної родини Цучімікадо, та Яку, яка нібито є реінкарнацією її знайомого, Харутора не має жодного таланту і натомість вирішує жити звичайним життям. Але коли відомий співробітник агентства «Онмьо» намагається відтворити той самий експеримент, який призвів до падіння Японії, Харутора вирішує дотримати свого слова і боротися на боці Нацуме.