Одного разу, коли Рему Мікаґе розмовляє по відеозв'язку зі своєю сестрою Шікі, яка поїхала до школи на футуристичний острів Окіноторі – Мега Флоат Сіті, вона зізнається, що і аудіо, і візуальні образи, які вона бачить, є повністю штучними. Щоб бути більш ефективною у навчанні, Шікі використовує наномашини з нейронними зв'язками для завантаження своєї свідомості в комп'ютер і зберігає своє фізичне тіло в «боді-пулі». Хоча Рему і шокований, він підтримує рішення сестри, аж поки не відбувається катастрофа, відома як «Дострокове вознесіння».

Раннє Вознесіння призводить до того, що всі, хто завантажив свою свідомість, або впадають у кому, або гинуть. Рему востаннє відвідує порожню квартиру своєї сестри, але шокований, коли на порозі з'являється Шікі. Не пам'ятаючи ні сім'ї, ні минулого, переслідувана жорстокою групою дослідників, Шікі та її брат змушені тікати, використовуючи новознайдену здатність маніпулювати наномашинами.