Одного дня місто раптово зникає. Такуя, професійний кур'єр за контрактом і вовк-одинак, зустрічає Юкі, єдину вцілілу після зникнення міста. Вони покладаються на повідомлення від батька Юкі, якого вважали зниклим безвісти, і вирушають до зниклого міста Лост.

Однак перед парою постають несподівані перешкоди, а реальність особливо шокує Юкі. Перед ними постають почуття тих, хто залишився позаду, таємнича група, що маніпулює в тіні, і розкривається прихована змова. Такуя і Юкі, які спочатку були незнайомцями, під час подорожі поглиблюють свій зв'язок і розгадують таємницю зниклого міста.