Мюнхен, Німеччина, 1923 рік. Два роки минуло відтоді, як Едвард Елрік потрапив у наш світ, залишивши свою батьківщину, друзів і молодшого брата Альфонса позаду. Залишившись без своїх алхімічних здібностей, у надії колись знайти шлях додому, він увесь цей час займався вивченням інженерної справи разом з Альфонсом Гайдеріхом, молодою людиною, надзвичайно схожою на його рідного брата. Однак усі його зусилля не принесли жодних результатів.
Але все змінюється, коли Едвард простягає руку допомоги циганській дівчині, яка потрапила в біду. Волею випадку, він опиняється в самій гущі подій, здатних принести руйнування обом світам.
Водночас у своєму рідному світі Альфонс Елрік продовжує все глибше занурюватися у вивчення таємниць алхімії в пошуках способу знову зустрітися зі своїм братом.