Вийшовши переможцем із жорстокого підпільного турніру, Бакі Ханма продовжує свій шлях до перемоги над батьком, Юджіро, найсильнішою людиною у світі. Однак він не має часу на відпочинок, коли до нього в школу приходить учасник турніру, Токугава Міцунарі. Він розповідає Бакі, що п'ятеро неймовірно небезпечних засуджених до смертної кари з усього світу, які володіють бойовими мистецтвами, одночасно втекли з ув'язнення і прямують до Токіо, кожен з яких бажає нарешті відчути смак поразки. Токугава попереджає, що через свою загальновідому силу Бакі рано чи пізно обов'язково зіткнеться з ними, і він буде не єдиною їхньою мішенню.

Адаптація першої саги другої серії манґи, «Бакі» зосереджується на тотальній війні між шанованими майстрами бойових мистецтв Японії та представниками темного підземного світу.