Койомі Арарагі, учениці третього класу середньої школи, вдається пережити напад вампірів за допомогою Меме Ошіно, дивного чоловіка, що мешкає в покинутій будівлі. Хоча він врятований від вампіризму і знову став людиною, деякі побічні ефекти, такі як надлюдські здібності до зцілення та посилений зір, все ще залишаються. Незважаючи на це, Арарагі намагається жити життям звичайного учня, з допомогою свого друга і президента класу Цубаші Ханекави.

Коли однокласниця Хітагі Сендзьогахара падає зі сходів і її ловить Арарагі, хлопець розуміє, що дівчина неприродно невагома. Незважаючи на протести Сендзьогахари, Арарагі наполягає на тому, щоб допомогти їй, і вирішує заручитися підтримкою Ошіно, того самого чоловіка, який колись допоміг йому в його власній скруті.

Через кілька історій за участю демонів і богів Бакемоноґатарі слідує за Арарагі, який намагається допомогти тим, хто страждає від надприродних хвороб.